祝由科的来历和传说
在上古时代，医师就是巫师，差不多全世界各民族都是一样。巫师运用他的法术，驱使鬼神，为人民解灾、救难、治病。他们甚至能起死回生。所以，在古代，“巫医”两个字总是连在一起的。到后世，用药物治病的医道发明了，出现了不用巫术的医师，于是“巫”与“医”才分了家。
祝由科是巫师的后裔，他们的来源很古。东汉时，张道陵创立“道教”，其法术融合了一部分方术、巫术的内容。祝由之术是传统道法的一个重要分支，祝由科是对祝由之术的一个统称，源自祝由天医十三科的说法。
“祝由”一说，从现存典籍来看，最早见于《黄帝内经》中的《素问》和《灵枢》。据这两本书的描述和“祝由”一词的本义，“祝”是指“祝祷”，多半是由“巫”来承担的，因为“巫”和“祝”在古代基本上具有同样内涵。“由”则指病因、病由。因此“祝由”就是根据病因之所在，用祝祷去治病的方法。
《素问》说它是一种“古之治病”的方法，是通过“移精变气”的手段来达到其去除病因的目的。由此可知，“祝祷”只是人们可以目睹的表面形式，真正实质性的除病过程是在超越感观以外的“移精变气”中去进行的。
又据《灵枢》，祝由这种治病方法，自来就善治那种突如其来、既无外因又无内因的怪病。这种病一般人都归于鬼神所为，因此由巫来祝祷就是理所当然的了。但歧伯认为，其中也有病邪留在体内“未发”，一旦病者心中情志波动，“血气内乱”、正邪“两气相搏”而成病的。由于这种病的病因(物质结构)极其微细，“视之不见、听而不闻”，因此就像鬼神引起的一样。
当黄帝问为甚么可以祝祷而治愈时，歧伯回答说，古代那些巫，由于知道各种疾病的克制方法，又预先看到病是从哪里来的，因此用祝祷来治疗就能奏效。按《历代职官表》所载，“祝由”治病的方法在周代至唐代以前的官方医疗机构中都没有被提到，但是在唐代的“太医署”中却是四大科之一，只不过名字叫作“咒禁”，更加强调其“祝祷”的内涵以及祷词的“咒语”性质。唐代的“太医署”既是医学教育机构，又是医疗单位，在编制上分为四科：医科、针科、按摩科、咒禁科。每一科中设“博士”、“医师”、“医工”等，在当时的“咒禁科”中设有“咒禁博士”、“咒禁师”、“咒禁工”等。
元代以后医事更加的分化，分为十三科，即；祝由科、大方脉科、小方脉科、杂脉科、风科、产科、眼科、口齿科、咽喉科、正骨科、金疮肿科、针灸科、禁科（指使用禁方、禁药和单方重剂治疗病邪的方法），故民间有“中医十三科，不识祝由科，别称十三科之说”。
明代的最高医疗管理和教育机构是“太医院”。太医院中设有十三科：大方脉、小方脉、妇人、疮疡、针灸、眼、口齿、接骨、伤寒、咽喉、金镞、按摩、祝由。因祝由科排在十三科之末，所以有“祝由十三科”之称。到了清初，太医院的科别设置减为十一科，祝由科被排斥出了太医院。
由于祝由科和气功治病有某些相同点：都不使用药物；治病机制都不能用通常的医学理论来解释等等，因此也有些人便把它和气功治病混同起来。
清朝人许叔平在《里乘》卷三中说：“祝由氏治疾不用药，唯以清水一碗，以手捏剑诀，敕勒书符水面，以饮病者，亦无不效。”《里乘》中还说，“祝由氏为湖南辰州府人，故今辰州人，多擅此术，名曰‘祝由科’。为人治病，誓不受钱币之谢，或酬以酒食既可。然擅此术者虽多，而真得秘传者甚少，如得真传者，实有起死回生之功”。
故事一：
有一篇赵海涛先生写的《祝由科的邪门邪术》，报告他对祝由科的亲身所见与体验，文笔虽不免有些传奇性，却不失其真实性。赵海涛先生这样写的：
小时候，我们家住在江苏常州礼嘉桥。礼嘉桥是个仅有百余家铺面的小镇，濒运河支流北岸。每隔半年，准有一位光头，穿长袍布鞋的祝由科郎中出现。每次来就住在我们家隔壁的一小客栈里。清早起身，先在院子里焚香烧纸，膜拜天地，然后再开始街边摆地摊。
这位祝由郎中就坐在一张小破书桌后面，悠游自得地摇着折扇，大吹法螺。破书桌上面，摆着几本不知名的药书和几叠黄裱纸。每本书都是破旧不堪，字迹模糊难辨。
如有人身上长瘤、长疱、长疮，不论部位在哪一处，他从不叫患者揭开衣服来详细检视。只是以手指在患部大约估量一下尺寸，然后用黄裱纸剪一人形，吐把口沫，往门板上一贴。用毛笔在纸人上之相同部位画一圆圈，取银针一枚，轻轻插进那圆圈里，只听得患者大喊一声“哎哟”，血水与黄浓立刻自患部流了出来。这时，他趁机拿一副膏药卖给患者，让患者自行贴上，没几天就好了。
镇上有家豆腐店小孩子，约有七、八岁，面黄饥瘦，腹胀如鼓。找了很多医生看，服了不少的药，都不见效。最后孩子的母亲，以“不防试试”的心情，将他牵到这位祝由郎中跟前。
祝由郎中将孩子眼皮翻翻，在大肚皮上略略一按，然后对他的母亲大声说：“快拿马桶来！”“什么”他母亲有点莫名其妙：“拿马桶来派啥用场？”这时围观的人，也都是轰然大笑。祝由郎中不再说话，照样用黄裱纸剪个人形，贴在门上，拿起银针往纸人腹部一戮。不一会，只见那孩子双眉紧皱，两手棒着肚皮直嚷痛，他母亲见状，赶紧将他挽着回家，刚走到豆腐店门口，那孩子“樸”的放个响屁，接着一股黄水，像阵瀑布似的从肛门里泻了出来，流满一地，臭不可闻，从此腹胀也就霍然而愈。
我那时头上长有瘌痢，每天放学回家，总爱挤在那位祝由郎中的摊子跟前看热闹。他一看见我，就用扇子指着我，阴阳怪气的笑着说：“XX瘌痢头，赶快向我求。若要瘌痢好，给我嗑个头。”气的我转身就跑。
有一次，他拉着我说：“你拿一枚铜板给我，变个把戏给你看，铜板仍旧还给你，不要磕头，瘌痢也会好。”
于是我当着众人，疑信参半的掏了一枚铜元给他，他将铜元用一张黄裱纸包起来，放在我的右脚下面，要我踩着。一边用折扇轻敲着我的脑袋，一边轻声念那四句话：“XX瘌痢头，赶快向我求。若要瘌痢好，给我磕个头。”
念完叫我松开脚，捡起纸包打开一看，铜元没有了，只有很小一包黄色药粉。
“把药粉拿回去泡一杯水，抹在瘌痢上。”他说。
“铜板呢？”我说。
“铜板在你家后院的一棵桃树下面，赶快回去捡！”他说着把我推出了人群。
我拿着药粉跑回去一看，果然在桃树下面拾到了那枚铜元。而头上的瘌痢涂了药粉以后，不到几天就渐渐好了。
故事二：
在一本笔记类的书籍中看到过一篇小标题就叫“祝由科”的短文：
民国初年，作者认识一位教会医院的院长，是个德国医生。这人从德国来到中国行医治病，同时宣扬基督教。一天，作者去看望这个院长，院长说他自己病得很厉害，要回德国去做手术，以后能不能再来中国都很难说了。
作者问他得了什么病？他说背上长了一个巨大的疖疮，中间已经开始溃烂，手头的针和药都没有效果，必须回国做手术，再拖下去怕溃烂感染就保不住这条命了。
作者说我们中国人治疗疮疖之类的小病，有的是办法呀，你要不要试试。这个德国院长本来是不相信中医的，事到如今也只好拜托作者为他找个中医来看看，作者就给他找了一个祝由来看病。
怎么看呢？让这个德国人对着一颗树面东闭目而站，医师拿毛笔蘸了朱砂在树上画一个圈。然后站在德国人背后，嘴里念念有词，一边念叨一边拿朱砂笔在那个疖疮上画圈，越画越小，最后画到中心用笔一点，嘴里再念叨几句说声“好了”。
结果神奇的事情发生了：德国人说背不痛了，作者上前查看那个大疖疮已经不见了，只留了一点痕迹。德国人摸着背纳闷地问：大疖疮哪里去了？医师说：你们往树上看。这时候再看树上那个朱砂画的圈里，原来平整的树皮硬是鼓起一个包来，形状与德国人背上原来的大疖疮几乎一模一样，中间也是发黑的。可以想象到那个德国人的惊讶程度。
作者在文章最后写到：这是他所知道的中西医对抗中，中国祝由科的一次伟大胜利。
故事三：
王亭之先生对祝由科感兴趣，是由于有一家姓邬的街坊，是番禺富户，他们家有一位小姐，生来驼背，后来曾一度为祝由科治好。后来这家人的十五少爷，恰恰与王亭之做同班同学，彼此来住甚密，听他的叙述，便更知道事情的始末。
他亲眼看着姊姊治驼背。祝由科医生来到，启坛画符唸咒一番，然后在大厅正中摆放一个“猪腰盘”──这种盘，上四十岁的人一定见过，用锌铁制造，给小孩子洗身，就用这种盘。
祝由科在盘内放下一只田鸡，吩咐主人家往盘内添上一寸水，然后在盘边放一矮凳，那就是广府人称为“凳仔”那一种。
摆设完毕，订阅号奇门遁甲法术，又在盘内烧一张符，便教人带那女孩出来，站在矮凳上。吩咐主人家，他一边念咒烧符，一边要叫女孩自动跳下盘内，不得推她。当时主人家见他准备一大叠符，心想，就这么一跳就完事了，要这么一叠符干吗？
谁知，那女孩子一站上矮凳，往盘中一望，就硬是不肯跳。女孩已经七八岁，照道理，就这一尺不到的高度，跳下去应该没有甚么可怕。全家人拼命鼓励她，她不跳就是不跳，眼见祝由科手上的符，已经烧了大半叠，众人不由得心焦。那祝由科半闭着眼睛念咒，也念得满头大汗。
就在这时，那祝由科便大喝一声了。
驼背女孩忽地脸色惨白，随即尖叫，人却已掉下盘中去了。众人才松一口气，皆大欢喜。
祝由科又往盘中烧符，不住念咒，良久事毕，吩咐主人家就用这个盘替女孩冲凉。可是，由于那女孩子的缘份不够，因此她必须终身不得吃田鸡，如若不然，驼背会复发。
说来奇怪，女孩经此一跳，慢慢就觉得她的脊骨长直了。一家人自然非常欢喜。
可是，他们是富户，讲究不时不食，每到田鸡肥美之时，自然享受田鸡食制，番禺人特别喜欢生滚田鸡粥，那时种田不下农药，田鸡便特别鲜美。
他们家孩子多，便不懂忌讳，吃田鸡必啧啧称好，那女孩只好听着，干流口水。她到底是女孩子心性，不知厉害，便老是缠着妈妈，要试一试田鸡的滋味。
如是捱了两年，又到田鸡当造的季节了，那母亲毕竟心软，有一次，就在田鸡腿上撕下小小一块肉，放在那女孩嘴中，让她嗒嗒味道。谁知这样一来，就闯出大祸。那女孩背骨，从此便愈长愈曲，过得一年，驼得比从前还要厉害。再去找那祝由科时，祝由科拒绝再医治。
其实，古代的商人们为社会商品流通所做的贡献是不可忽视的，只是，被传统的重农轻商的思想观念给坑惨了。
如今，商人的价值得到了充分体现，现在是有钱人的天下，只要能逮住老鼠，就会有大把的荣誉与美女。现在，嫁给成功的商人（该改叫企业家），又成了许多追求美好生活的年轻女性的首要之选。
看来，所谓的老话，也只是在某些特定的历史时期才能做为人生指南的。与时俱进，才是不可回避的选择。