现今社会上对邱处机之姓写法不一，有的写“丘”，有的写“邱”。地方志编写要求规范和统一,经认真考虑和研究，认为应统一写法，一律用“邱”，理由如下：

1、“丘”为原姓，后被改为“邱”。历史上，“丘”改“邱”共三次，第一次是西汉时期，当时废除百家，独尊儒术，为避孔“丘”讳，朝廷颁诏改“丘”为“邱”。但《元史》作者疏于儒家传统与习俗，仍用“丘”字，有人据此延续至今。第二次是金明昌三年（1192）修曲阜孔庙时，命臣庶回避孔“丘”之名，其域内“丘”姓改为“邱”姓。第三次是雍正三年（1725），这次影响最大、范围最广，雍正帝诏令“丘”改为“邱”姓。

2、北京白云观（中国协会驻地）内邱处机灵堂即为“邱祖殿”。

3、栖霞市太虚宫亦是“邱祖殿”,而非“丘祖殿”。

4、栖霞市境内有“邱”姓而无“丘”姓。

5、清代光绪五年《栖霞县志》中亦写作“邱处机”。

为发展栖霞旅游事业，适应新形势要求，规范姓氏用法，《栖霞市志》（1985～2002）已将“丘处机”改为“邱处机”，此建议以请示的形式上报市政府研究， 2010年5月26日，市政府给予批复，同意改“丘处机”为“邱处机”。